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食品檢驗項目服務于檢驗目的，并且可以根據(jù)檢驗目的對食品檢驗項目進行某些選擇。有些選擇顯而易見。例如，許多綜合蔬菜市場配備的“快速檢測室”通常主要用于檢測農業(yè)殘留物。為什么不檢查蔬菜表面的菌落總數(shù)？一方面，微生物指標的食品檢測門檻較高，包括設備和時間，沒有人會等48小時才得到一捆生菜等食品檢測結果。另一方面，大多數(shù)細菌會在清洗和高溫烹飪過程中被。清洗和高溫處理前的菌落總數(shù)沒有參考值。因此，需要高溫蒸煮的農產品和食品原料不具備測試菌落總數(shù)的充分和必要條件。

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食品檢測安全是關系到每個家庭和每個人的重要基本生活問題。加強監(jiān)管和提高食品檢測行業(yè)的質量是實現(xiàn)食品安全狀況持續(xù)穩(wěn)定改善的根本基礎。食品檢驗作為食品檢驗安全的重要組成部分和關鍵環(huán)節(jié)，意義重大。霉菌和酵母在自然界中非常常見。霉菌會破壞食品檢測，破壞食品的顏色、香氣和味道，降低食品檢測的食用價值。

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近年來，隨著國外檢驗機構的出現(xiàn)，國內食品檢驗機構在建筑材料檢驗和微生物檢驗方面面臨信任危機。一般來說，我國出具的報告很少得到國外的認可，因為國外認為我國的食品檢驗機構有太多的人工操作和人為干預，這使得食品檢驗數(shù)據(jù)有很多人為因素。為了避免這個問題，國內許多實驗室都在檢查和實施LIMS系統(tǒng)。LIMS在中國出現(xiàn)較早，通常用于石油、石化、制藥和其他制造業(yè)的實驗室。然而，第三方食品檢測機構的實施早就屬于藥品檢測行業(yè)。LIMS系統(tǒng)先后在滬、穗、京、大藥檢所實施，并已正式投入運行。其他行業(yè)的第三方食品檢驗機構也在積極調查。

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